Windows CE.NET的桌面确实漂亮，但是如果我们的嵌入式系统使用微软的桌面，总让我感觉不伦不类。因此，要想个办法，让我们的程序开机启动，把微软的那个桌面 给替换掉。 其中使用startup的快捷方式再加上隐藏任务栏的方法，效果非常的好，但是每次启动的时候，总是微软的桌面先出来，再启动我们的程序，感觉还是不爽。 最近发现一种方法， 1) 首先新建工程，把你的应用程序放到内核里面去（前面介绍了如何做）； 2) 编译平台； 3) 修改shell.reg的文件 ： 在文件中有这样一行： [HKEY_LOCAL_MACHINEinit] “Launch50″=”explorer.exe” “Depend50″=hex:14,00, 1e,00 把这个explorer.exe改成你的应用程序（比如：MyApp.exe）就可以了； 4) Platform Builder IDE：【Build】->【Make Image】（记得千万不要Build或者Rebuild） 5) 成功后，得到的NK.bin（或NK.nb0）就包含了应用程序MyApp.exe和MyApp.lnk，当把相应的内核烧入开发板MyApp程序就会在 系统启动时自动运行。
至此,随心所欲的让自己的程序在Windows CE系统启动时自动运行了，一个字，爽!
注意：如果自己的程序有关闭退出之类的按钮，切忌不要点击，最后做到让其消失！！！